成大歷史系於民國58年成立，座落於古蹟之中，前身為日軍臺灣步兵第二聯隊營舍，同時也是國內研究臺灣史的先驅，透過史蹟勘考活動，蒐集歷史文物，並且部分收藏於成功大學歷史文物館當中，讓歷史文物館也成為教學與活動場域之一。

歷史系教學課程涵蓋臺灣史、中國史、世界史三大領域，同時也運用地處臺南的優勢，與臺南市政府、國立臺灣文學館、國立臺灣歷史博物館、各宗教團體和文史工作者常有合作，編寫地方志或進行各種田野調查、口述歷史等計劃，也開設相關課程供學生選修。

此外，成功大學作為綜合型大學，歷史系也透過跨領域整合的方式，長年與醫學院、理學院、工學院、社會科學院、規劃設計學院等合作一起推動臺南四百、科普、地方醫療史、醫學教育、科技與社會等跨領域教研計畫。同時，面對AI浪潮，歷史系也規劃不同數位人文課程，例如「維基融入歷史教學」、「史學研究的數位工具」、「如何因應生成式AI對歷史學的衝擊」等，思考AI帶來的機會與挑戰。

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